Die benthische Makrofauna spielt eine zentrale Rolle, wenn es um die Verteilung organischer Stoffe innerhalb von Sedimenten gehen. Benthische Organismen durchwühlen das Sediment durch Grab- und Pumpbewegungen und wühlen damit auch organische Partikel von der Oberfläche in tiefere Schichten (Biotubation). Ein Rückgang benthischer Aktivität kann somit auch Folgen für die Funktionalität von Ökosystemen haben, da organische und anorganische Substanzen nicht mehr effektiv in das Sediment gearbeitet werden. Wir haben ein Experiment durchgeführt, bei dem die Bioturbationsraten von zwei benthischen Organismen unter verschiedenen Individuendichten und Nährstoffanreicherungsbedingungen gemessen wurden. Mit einer Luminophore-Tracer-Methode, bei der fluoreszierende Sandpartikel verwendet werden, verfolgten wir das Sedimentaufbereitungsverhalten der Organismen. Die Analyse der Sedimentprofilbilder zeigte, dass eine Verringerung der Organismen die Bioturbationsraten erhöhte, wobei das Material im Vergleich zu natürlichen Dichten deutlich flacher vergraben wurde.

Die Endofauna umfasst alle Tiere, die im Meeresboden leben. Für deren Untersuchung wurden insgesamt 85 Stationen auf der Doggerbank, dem Sylter Außenriff und dem Borkum Riffgrund beprobt. Die statistische Datenanalyse zeigt, dass jedes Gebiet seine eigene Endofauna-Gemeinschaft aufweist.Zudem zeigen erste Ergebnisse, dass es auf der Doggerbank und im Sylter Außenriff signifikante Zusammenhänge zwischen der Artenvielfalt der Endofauna und der Fischereiintensität, aber auch der Sedimentstruktur gibt.

Parallel wurde die Epifauna in den Natura 2000 Gebieten beprobt. Die Epifauna umfasst jene Tiere, die auf dem Meeresboden leben. Die Untersuchung zeigt, dass sich die Artenvielfalt der Epifauna in den drei Gebieten unterscheidet, beeinflusst durch die unterschiedlichen Umweltparameter. Die Ergebnisse einer Epifauna-Langzeitdatenanalyse von der Doggerbank über die letzten drei Dekaden weisen darauf hin, dass die Epifaunagemeinschaften in den 1990er Jahren primär durch die Fischereiintensität beeinflusst wurden, während sie seit 2003 vermehrt durch die klimatisch bedingte Erhöhung der Wassertemperatur um 4 °C (>25 m Wassertiefe) verändert wurden.

Um den Einfluss mobiler, grundberührender Fischerei auf den Meeresboden und die Sediment-beschaffenheit und -struktur zu untersuchen benutzen wir hydroakustische Methoden (e.g. Sonar). Die Rückstreustärke des akustischen Signals gibt dabei Aufschluss über die Beschaffenheit des Meeresbodens. Dadurch können wir erkennen wo Schleppnetze über den Meeresboden gezogen wurden. Erste Ergebnisse aus dem Project zeigen, dass die detektierbaren Strukturen am Meeresboden bereits nach wenigen Monaten wieder verschwinden. Die Sedimente scheinen sich, bewegt durch Meeres-Strömungen, relativ schnell wieder einzuebnen.

Der Test und die Entwicklung nicht-invasiver Probanahmemethoden ist ein wichtiger Bestandteil von MGF-Nordsee. Der Einsatz von beköderten Unterwasservideostationen (BRUV) ermöglicht einzigartige Einblicke in die Unterwasserwelt der Nordsee.
Im ersten Projektjahr konnten bereits viele interessante Aufnahmen in den Natura 2000 Gebieten erfasst werden, die helfen, die Artenvielfalt in den Gebieten zu ermitteln.